获取宝石最直接的方式是深入地下层或洞穴层进行挖掘。红宝石、钻石等各类宝石通常生成于地下53-150层的岩块中，外观会发出对应颜色的光芒，使用铁镐或更高级的镐类工具即可开采。宝石洞穴是高效采集点，其内部会密集生成特定种类的宝石，配合洞穴探险药水可使矿物高亮显示，显著提升探索效率。需不同深度的地层会分布不同种类的宝石，例如地狱层更适合获取稀有宝石。
首先需通过砍伐普通树木获取橡实，并在地下挖掘天然宝石树获得初始宝石。将橡实与任意宝石合成宝石果后，将其种植在地下层、洞穴层或地狱层的石块上。种植时需确保树苗左右各留三格空间，上方至少预留十一格高度。宝石树成熟后会周期性产出对应宝石，紫晶、黄玉等七种宝石均可通过此方式稳定获取。该方法前期投入较大，但后期可实现自动化收集。
使用提炼机转化特定物块是概率性获取宝石的补充手段。将泥沙块、雪泥块或沙漠化石放入提炼机，有几率精炼出宝石或宝石果。提炼机通常生成于沙漠地下的宝箱或人工房间内，虽单次产出不稳定，但配合大量物块储备可提高收益。此方法适合在探索过程中顺带进行，尤其对无法直接挖掘的琥珀而言是唯一获取途径。
探索天然宝石洞能一次性获取大量宝石。这类洞穴通常隐藏于岩石墙后，需破坏墙体或使用危险感药水辅助定位。宝石洞内会集中生成单一或混合类型的宝石簇，同时可能包含宝箱等额外资源。该方法对装备要求较低，但需要玩家具备较强的地形辨识能力，适合中期资源积累阶段采用。
玩家应根据当前游戏阶段、资源储备和装备水平灵活选择组合策略，以实现宝石资源的最大化获取。
